MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_013205	GC	3	6	146892	146897	0 %	0 %	50 %	50 %	258510150
3503	NC_013205	CGG	2	6	146901	146906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510150
3504	NC_013205	GTG	2	6	146930	146935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510150
3505	NC_013205	GCTC	2	8	146980	146987	0 %	25 %	25 %	50 %	258510150
3506	NC_013205	GGT	2	6	147004	147009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510150
3507	NC_013205	GCT	2	6	147043	147048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510150
3508	NC_013205	CGC	2	6	147051	147056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510150
3509	NC_013205	GAC	2	6	147109	147114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510150
3510	NC_013205	CG	3	6	147156	147161	0 %	0 %	50 %	50 %	258510150
3511	NC_013205	GTG	2	6	147164	147169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510150
3512	NC_013205	TGG	2	6	147198	147203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510150
3513	NC_013205	GGC	2	6	147212	147217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510150
3514	NC_013205	GCG	2	6	147265	147270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510150
3515	NC_013205	CCG	2	6	147284	147289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510150
3516	NC_013205	GC	3	6	147361	147366	0 %	0 %	50 %	50 %	258510150
3517	NC_013205	GGC	2	6	147376	147381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510150
3518	NC_013205	GTC	2	6	147392	147397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510150
3519	NC_013205	GCG	2	6	147401	147406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510150
3520	NC_013205	GGT	2	6	147484	147489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510150
3521	NC_013205	GC	4	8	147512	147519	0 %	0 %	50 %	50 %	258510150
3522	NC_013205	AGC	2	6	147522	147527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510150
3523	NC_013205	TCGC	2	8	147530	147537	0 %	25 %	25 %	50 %	258510150
3524	NC_013205	AAC	2	6	147676	147681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_013205	ACA	2	6	147686	147691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_013205	TGG	2	6	147706	147711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_013205	GAGC	2	8	147812	147819	25 %	0 %	50 %	25 %	258510151
3528	NC_013205	TCT	2	6	147888	147893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510151
3529	NC_013205	CCG	2	6	147894	147899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510151
3530	NC_013205	GGT	2	6	147939	147944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510151
3531	NC_013205	CTT	2	6	147997	148002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510151
3532	NC_013205	TGT	2	6	148022	148027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510151
3533	NC_013205	GC	3	6	148113	148118	0 %	0 %	50 %	50 %	258510151
3534	NC_013205	GCC	2	6	148169	148174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510151
3535	NC_013205	ATTTTC	2	12	148210	148221	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	258510151
3536	NC_013205	CGA	2	6	148224	148229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510151
3537	NC_013205	CAA	2	6	148233	148238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510151
3538	NC_013205	AGGGCA	2	12	148298	148309	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	258510151
3539	NC_013205	TCA	2	6	148325	148330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510151
3540	NC_013205	AGG	2	6	148337	148342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510151
3541	NC_013205	TTC	2	6	148387	148392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510151
3542	NC_013205	GA	3	6	148431	148436	50 %	0 %	50 %	0 %	258510151
3543	NC_013205	TTG	2	6	148442	148447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510151
3544	NC_013205	TCG	2	6	148559	148564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510151
3545	NC_013205	CCT	2	6	148575	148580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510151
3546	NC_013205	CGTG	2	8	148608	148615	0 %	25 %	50 %	25 %	258510151
3547	NC_013205	GCG	2	6	148624	148629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510151
3548	NC_013205	CGAC	2	8	148679	148686	25 %	0 %	25 %	50 %	258510151
3549	NC_013205	GC	3	6	148765	148770	0 %	0 %	50 %	50 %	258510151
3550	NC_013205	TGA	2	6	148790	148795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510151
3551	NC_013205	TGG	2	6	149008	149013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_013205	GTA	2	6	149044	149049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510152
3553	NC_013205	GC	3	6	149078	149083	0 %	0 %	50 %	50 %	258510152
3554	NC_013205	CAC	2	6	149230	149235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510152
3555	NC_013205	CCG	2	6	149266	149271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510152
3556	NC_013205	GAC	2	6	149275	149280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510152
3557	NC_013205	TGA	2	6	149304	149309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510152
3558	NC_013205	ACA	2	6	149316	149321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510152
3559	NC_013205	TCG	2	6	149351	149356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510152
3560	NC_013205	GTA	2	6	149428	149433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510152
3561	NC_013205	CCA	3	9	149457	149465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510152
3562	NC_013205	TGT	2	6	149466	149471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510152
3563	NC_013205	AGA	2	6	149550	149555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510152
3564	NC_013205	GCCA	2	8	149602	149609	25 %	0 %	25 %	50 %	258510152
3565	NC_013205	TCG	2	6	149612	149617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510152
3566	NC_013205	TG	3	6	149638	149643	0 %	50 %	50 %	0 %	258510152
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3569	NC_013205	TCC	3	9	149681	149689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510152
3570	NC_013205	CG	3	6	149700	149705	0 %	0 %	50 %	50 %	258510152
3571	NC_013205	ATG	2	6	149714	149719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510152
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3573	NC_013205	CTT	2	6	149869	149874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510152
3574	NC_013205	GTC	2	6	149930	149935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510152
3575	NC_013205	GCA	2	6	150084	150089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510153
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3578	NC_013205	CGC	2	6	150315	150320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510153
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3580	NC_013205	G	6	6	150360	150365	0 %	0 %	100 %	0 %	258510153
3581	NC_013205	CG	3	6	150379	150384	0 %	0 %	50 %	50 %	258510153
3582	NC_013205	CCG	2	6	150437	150442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510153
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3584	NC_013205	CGT	2	6	150474	150479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510153
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3588	NC_013205	G	6	6	150962	150967	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_013205	CGC	2	6	150974	150979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_013205	CGAG	2	8	151034	151041	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3591	NC_013205	ACGAAG	2	12	151107	151118	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	258510154
3592	NC_013205	GC	4	8	151265	151272	0 %	0 %	50 %	50 %	258510154
3593	NC_013205	GAG	2	6	151337	151342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510154
3594	NC_013205	GC	3	6	151417	151422	0 %	0 %	50 %	50 %	258510154
3595	NC_013205	GGA	2	6	151500	151505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510154
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3599	NC_013205	CAA	2	6	151633	151638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510154
3600	NC_013205	GGA	2	6	151645	151650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510154
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3602	NC_013205	CCCA	2	8	151673	151680	25 %	0 %	0 %	75 %	258510154
3603	NC_013205	GCG	2	6	151689	151694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510154
3604	NC_013205	CGC	2	6	151724	151729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510154
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3606	NC_013205	AGG	2	6	151762	151767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510154
3607	NC_013205	CG	3	6	151888	151893	0 %	0 %	50 %	50 %	258510154
3608	NC_013205	GGC	2	6	151911	151916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510154
3609	NC_013205	CTG	2	6	151988	151993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510154
3610	NC_013205	GTC	2	6	151997	152002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510154
3611	NC_013205	CGGCG	2	10	152029	152038	0 %	0 %	60 %	40 %	258510154
3612	NC_013205	TCA	2	6	152055	152060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510154
3613	NC_013205	GCA	2	6	152106	152111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510154
3614	NC_013205	GGT	2	6	152116	152121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510154
3615	NC_013205	TC	3	6	152135	152140	0 %	50 %	0 %	50 %	258510154
3616	NC_013205	TTG	2	6	152187	152192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258510154
3617	NC_013205	GTGGC	2	10	152207	152216	0 %	20 %	60 %	20 %	258510154
3618	NC_013205	GAA	2	6	152230	152235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510154
3619	NC_013205	CTTCCG	2	12	152280	152291	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	258510154
3620	NC_013205	AGG	2	6	152334	152339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_013205	GTGGC	2	10	152418	152427	0 %	20 %	60 %	20 %	258510155
3622	NC_013205	TGA	2	6	152454	152459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510155
3623	NC_013205	GTG	2	6	152465	152470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510155
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3625	NC_013205	TGA	2	6	152589	152594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510155
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